中国科学家与阿里达摩院合作研发的全流程智慧育种平台近日在国际顶尖期刊《分子植物》上发表论文。该平台实现了育种数据管理和分析、计算加速、AI预测亲本及优良品种的育种全流程整合。
传统育种方式成本高且周期长,而智慧育种通过模拟作物生长环境等信息,综合作物表型、基因型等数据建立模型,可以预测作物性状并筛选出优异基因型。这一技术依赖高通量数据分析和复杂的操作,对育种家来说是一大挑战。
为了解决这些问题,中国农业科学院作物科学研究所、国家南繁研究院与达摩院合作开发了高通量计算平台,并将其嵌入到智慧育种平台中。这个一站式服务为用户提供“低门槛”的支持。
目前已有23家科研机构使用该平台进行育种研究,其中包括中国水稻研究所、中国科学院遗传与发育生物学研究所、国际畜牧研究所等。数据显示,在网页端使用该平台时已经实现了针对基因测序数据的变异位点计算加速110倍,基因型过滤加速25倍以上,群体遗传学分析加速1000倍以上。
此外,该平台还具有丰富的功能和容量。它可支持上百个用户同时开展高效的育种大数据管理、调度和分析,并且其数据存储容量可达1PB。
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